Все описанные выше фильтры осуществляют био-фильтрацию с помощью бактерий. В принципе, это не является фильтрацией в прямом смысле этого слова. Органика не удаляется из системы, а только лишь происходит преобразование токсичных элементов в менее ядовитые (нитратный цикл). Эти вещества накапливаются в аквариуме и, рано или поздно, приходиться менять воду. С другой стороны, бактерии представляют собой дополнительную нагрузку на систему, они требуют кислород, они выделяют продукты жизнедеятельности, которые тоже должны быть переработаны. Чем больше требуемый объем фильтрации, тем больше популяция бактерий, тем больше потребление кислорода и выделение "мусора". Аквариум с таким типом фильтрации не является замкнутой системой и требует постоянного вмешательства в виде смены воды.
С другой стороны, растения поглощают органические вещества, в том числе нитраты и ядовитый аммиак, углекислый газ и выделяют кислород. Растения удаляют все эти вещества из системы, используя их для роста, т.е. являются фильтрами в прямом смысле этого слова. Растения поглощают аммиак в первую очередь и, потом, нитриты и нитраты. Дополнительным достоинством растений является и то, что они поглощают органические вещества, вызывающие рост водорослей в аквариуме (подробней про это написано в разделе про водоросли)
На этой способности растений поглощать органику основаны фильтры различных систем. При правильной их эксплуатации они являются очень эффективными. Безусловно, механический фильтр необходим, чтобы фильтровать крупную грязь. Растения, с листьями, покрытыми грязью, как понятно, неэффективны.
Конструкция подобного фильтра очень несложна, поскольку представляет собою аквариум (или дополнительную емкость), засаженную растениями. Для того, чтобы растения поглощали органику из воды им необходимо создать оптимальные условия, которые включают в себя, свет, удобрения и, желательно, углекислый газ. Самый простой способ осуществить такую фильтрацию - засадить аквариум растениями. Как показала практика (в том числе и моя), при активно растущих растениях - не нужен никакой дополнительный биофильтр. Хотя, лучше предусмотреть био-фильтрацию, на тот случай, если растения прекратят поглощать органику (отключение света на несколько дней, недостаток удобрений и т.д.)

Другой конструкцией может служить дополнительная емкость, засаженная растениями. Например два аквариума, соединенные вместе. Или второй аквариум, который освещается ночью. Этим достигается эффективная фильтрация и снабжение кислородом на тот период, когда растения в основном аквариуме "спят" (при этом они тоже поглощают кислород и выделяют углекислый газ). Такой вид фильтрации называется RDP - reversed daylight filtration (фильтрация с обращением светового дня).

В качестве растений следует использовать быстрорастущие, неприхотливые растения - чем оно быстрее растет, тем больше поглощает органики из воды, чем неприхотливее, чем проще его выращивание. Предпочтительнее плавающие растения, тогда вам не нужно использовать грунт и эти растения всасывают питательные вещества из воды, в противоположность тем, у которых развита корневая система.
Другим способом является выращивание гидропоники. Этот способ имеет то преимущество, что меньше шансов "получить" водоросли, поскольку свет не попадает в воду. Для осуществления такой фильтрации используйте неглубокую емкость, через которую протекает вода. На емкость полощите сверху сетку и насыпьте земли. Лучше всего использовать неприхотливые, быстрорастущие растения. Такой фильтр может выглядеть очень красиво.
Другим вариантом может служить выращивание растений, которые растут корнями, погруженными в воду - растения для террариумов и т.д. Одним из лучших "высасывателей" является мангровое дерево, но вряд ли вам удастся вырастить его в комнате. Такой фильтр можно оформить в виде террариума со своими обитателями.
Несколько слов о том, почему подобный фильтр называется водорослевым (algae scrubber). В пресноводном аквариуме подобные фильтры не получили широко распространения, поскольку если вам сложно вырастить растения в основном аквариуме, то тем более сложно создать подобный фильтр. А если у вас густой лес в аквариуме, то растения обеспечивают обычно фильтрацию. Отдельный фильтр эффективен, например, при содержании таких рыб, как цихлид, охотно поедающих растения. В морском, риф-аквариуме, подобный фильтр сейчас начинает достаточно широко использоваться. Поскольку морских высших растений практически нету, то вместо них используется макроводоросли. Они как-бы высасывают органику из воды (отсюда и название - scrubber). Основным, наиболее известным, энтузиастом такого вида фильтрации является W. Adey, куратор аквариума в Музее Естественной Истории в Вашингтоне, автор очень хорошей книги Dynamic Aquaria. Наиболее эффектным из его фильтров является фильтр для риф-аквариума в несколько кубометров. Фильтр представляет собой огромный аквариум, засаженный водорослями.
Вероятно можно использовать водоросли и в пресноводном аквариуме, однако это чревато тем, что они могут "перекинуться" в основной аквариум, да и наличие быстрорастущих растений делает водоросли ненужными.
В заключение можно добавить, что данный вид фильтрации является достаточно сложным (как и выращивание растений) для начинающих аквариумистов. После приобретения опыта можно использовать его, но для начала, имеет смысл использовать обычные фильтры. Ниже в таблице приведены основные отличия обоих видов фильтрации.
БактерииРастения
• Преобразовывают аммиак в нитриты и, далее, в нитраты
• Не выводят нитраты из системы
• Требуют кислород для своей жизнедеятельности
• Более просты
• Фильтрация 24 часа в сутки
• Требуют наличия фильтра
• Поглощают аммиак, нитриты и нитраты, удаляя их из врды
• Выводят органику из системы
• Выделяют кислород при фотосинтезе, поглощают при дыхании в темное время
• Более сложный вид фильтрации (требует освещения и т.д.)
• Фильтрация только при наличии освещении
• Заросший растениями аквариум выглядит более красиво, чем коробка фильтра
Устройство фильтра не является абсолютной необходимостью. Если в аквариуме соблюдено биологическое равновесие между его растительным и животным населением, в нем не слишком много рыб и он хорошо засажен растениями, то последние с успехом выполняют роль естественного фильтра. Для обогащения же воды гуминовыми кислотами можно помещать в аквариум куски торфа, как это указывалось в разделе о «бразильском» аквариуме.